Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trip4Q9QXN3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trip4Q9QXN3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms