Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpsf3Q9QXK7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms