Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mid2Q9QUS6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms