Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dkk3Q9QUN9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms