Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms