Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1aQ9JLR9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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