Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms