Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace2Q9JL18 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bace2Q9JL18 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms