Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx5Q9JKQ4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx5Q9JKQ4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx5Q9JKQ4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx5Q9JKQ4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx5Q9JKQ4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx5Q9JKQ4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx5Q9JKQ4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx5Q9JKQ4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx5Q9JKQ4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms