Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chrac1Q9JKP8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrac1Q9JKP8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms