Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrQ9JKK8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms