Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcan3Q9JKK0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rcan3Q9JKK0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms