Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2j1Q9JJZ4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2j1Q9JJZ4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms