Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfra4Q9JJT2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Gfra4Q9JJT2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra4Q9JJT2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms