Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad9Q9JIW5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms