Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacna1fQ9JIS7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1fQ9JIS7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1fQ9JIS7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms