Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod3Q9JHJ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod3Q9JHJ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms