Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn12Q9ET43 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms