Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Brd4Q9ESU6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Brd4Q9ESU6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Brd4Q9ESU6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms