Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk4Q9ERK0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk4Q9ERK0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms