Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlnrd1Q9ERE8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlnrd1Q9ERE8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms