Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dap3Q9ER88 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dap3Q9ER88 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms