Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms