Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r47Q9EQ51 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms