Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clstn1Q9EPL2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms