Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apbb2Q9DBR4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apbb2Q9DBR4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms