Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ftsj3Q9DBE9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms