Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tysnd1Q9DBA6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms