Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr53Q9DB94 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms