Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmbim4Q9DA39 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms