Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smco2Q9DA21 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smco2Q9DA21 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms