Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp12Q9D9M2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp12Q9D9M2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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