Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9H8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9H8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9H8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9H8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9H8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D9H8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9D9H8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9D9H8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9D9H8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms