Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1Q9D883 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1Q9D883 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1Q9D883 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms