Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf13Q9D777 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13Q9D777 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms