Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MsraQ9D6Y7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MsraQ9D6Y7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms