Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc52a3Q9D6X5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms