Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc94Q9D6J3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms