Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
4930449I24RikQ9D5E3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms