Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lonrf3Q9D4H7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf3Q9D4H7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms