Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syce1Q9D495 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms