Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lamp5Q9D387 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms