Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1cQ9D300 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1cQ9D300 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms