Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D2Q3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Q9D2Q3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms