Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms