Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C9

Rrp7a, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp7aQ9D1C9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp7aQ9D1C9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rrp7aQ9D1C9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms