Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd3Q9D176 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd3Q9D176 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms