Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsm12Q9D0R8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms