Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acsl3Q9CZW4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acsl3Q9CZW4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms