Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snf8Q9CZ28 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snf8Q9CZ28 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms